Một số người đã lo lắng về quyền của các thành viên trong cộng đồng LGBT khi tham dự giải đấu, vì đồng tính là bất hợp pháp ở Qatar và cũng có thể bị trừng phạt bằng việc tử hình đối với những người theo đạo Hồi dưới thời Sharia.[70] Sau khi Qatar được chọn làm chủ nhà, Blatter đã bị chỉ trích vì nói đùa với một phóng viên đang hỏi về những lo ngại rằng những người tham dự đồng tính "nên hạn chế bất kỳ hoạt động tình dục nào".[71][72] Để thứ lỗi khán giả về sự cố này, Blatter đảm bảo rằng FIFA không dung thứ cho sự phân biệt đối xử và tuyên bố rằng "những gì chúng tôi muốn làm là mở giải đấu này cho tất cả mọi người, và mở nó cho tất cả các nền văn hóa, và đây là những gì chúng tôi đang làm vào năm 2022."[73] Năm 2013, Hassan al-Thawadi tuyên bố rằng các khán giả sẽ được chào đón tại giải đấu, nhưng lưu ý rằng không nên thể hiện tình cảm nơi công cộng vì chúng "không phải là một phần của văn hóa và truyền thống của chúng tôi".[74]

Tháng 11 năm 2021, cầu thủ bóng đá người Úc Josh Cavallo, người đã công khai là đồng tính vào tháng 10 năm 2021, nói rằng anh sợ đến Qatar để thi đấu.[75] Nasser Al Khater, trưởng ban tổ chức giải đấu, trả lời rằng Cavallo sẽ được thi đấu tại Qatar.[76]

Tháng 12 năm 2020, các quan chức Qatar ban đầu tuyên bố rằng theo chính sách của FIFA, nó sẽ không hạn chế việc hiển thị hình ảnh ủng hộ LGBT (chẳng hạn như cờ cầu vồng) tại các trận đấu trong thời gian diễn ra World Cup.[77] Tuy nhiên, vào tháng 4 năm 2022, một quan chức an ninh cấp cao giám sát giải đấu đã tuyên bố rằng có kế hoạch tịch thu cờ cầu vồng từ khán giả - được cho là một biện pháp an toàn để bảo vệ họ khỏi sự xen kẽ với những khán giả chống LGBT. Cộng đồng mạng bóng đá chống phân biệt chủng tộc ở châu Âu (viết tắt là Fare) đã lên tiếng chỉ trích bản báo cáo, cho rằng các hành động chống lại cộng đồng LGBT của nhà nước là mối quan tâm của những người tham dự World Cup hơn là hành động của các cá nhân của các quan chức.[78][79] Tuy nhiên, Thiếu tướng Abdulaziz Abdullah Al Ansari, lãnh đạo cấp cao giám sát an ninh cho giải đấu, đã tuyên bố trong một cuộc phỏng vấn rằng các cặp đôi mang theo gen LGBT sẽ được chào đón trên toàn quốc và hướng tới việc thúc đẩy công khai quyền tự do của LGBT vì lá cờ cầu vồng chính là biểu tượng của sự tự do của cộng đồng ấy.[80]